Nasel jsem tento navod, ktery by mohl resit vas problem. Je to v anglictine, ale kratke a vyzivne 
http://fedorasolved.org/installation-solutions/dd-db-fix/
Já GRUB moc neznám, ale vím, že jsem instaloval na tři disky 6 systémů - W98, WXP, RH9, Manrake10, Solaris a Debian.
Debian jsem nainstaloval jako poslední a byl jsem připraven použít OS Loader 2000 pro bootování. Debian mě mile překvapil, všechny systémy našel a nainstaloval LILO, z kterého jdou všechny spouštět.
Tak jen zda nezkusit místo GRUBu LILO?
Obcas take preferuji LILO, protoze je preci jen pochopitelnejsi nez slozity grub. na druhou stranu grub ma spoustu moznosti ktere lilo nema a obcas prijdou velmi vhod.