Předpokládám, že jste v dobré víře, že budete mít kvalitní webový server, odklikal instalačního průvodce. Teď zkrátka nezbývá než začít studovat návody a dokumentace. Zkuste se alespoň pro začátek odpíchnout od nějakého správce souborů pro textový režim. Může jím být třeba Midnight Commander. Spouští se příkazem mc a pokud znáte stařičkého Norton Commandera, budete ve správě souborů doma. Nu a pokud mc nebudete mít nainstalován, doinstalujete ho třeba takto:
sudo yum install mc
Doporučuji ale minimálně začít přečtením zdejší příručky. Alespoň proto, abyste věděl, co je sudo a yum.
Dále, velmi kvalitní příklad sestavení dobrého firewallu je například na www.abclinuxu.cz.